Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAF1Q9H7N4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAF1Q9H7N4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms