Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
COMMD5Q9GZQ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms