Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms