Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM4Q9C037 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms