Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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FOXQ1Q9C009 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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FOXQ1Q9C009 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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FOXQ1Q9C009 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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FOXQ1Q9C009 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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FOXQ1Q9C009 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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FOXQ1Q9C009 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXQ1Q9C009 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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