Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BCO2Q9BYV7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BCO2Q9BYV7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms