Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM54Q9BYV2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms