Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms