Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC106Q9BWC9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms