Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SEC22CQ9BRL7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SEC22CQ9BRL7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SEC22CQ9BRL7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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