Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FYCO1Q9BQS8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms