Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMCHL2Q9BQD1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms