Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PKP4Q99569 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PKP4Q99569 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PKP4Q99569 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP4Q99569 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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