Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAM1Q96QH2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAM1Q96QH2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms