Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGF29Q96ES7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms