Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms