Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF34Q969K3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms