Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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