Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RGP1Q92546 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RGP1Q92546 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RGP1Q92546 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms