Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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C11orf40Q8WZ69 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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C11orf40Q8WZ69 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C11orf40Q8WZ69 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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