Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL2Q8NHH9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms