Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A3Q8NEV1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms