Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC112Q8NEF3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms