Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RNF182Q8N6D2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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