Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms