Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG4DQ86TL0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms