Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT28Q7Z3Y7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms