Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CATSPER4Q7RTX7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CATSPER4Q7RTX7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms