Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms