Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
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