Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRHL2Q6ISB3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms