Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLX4IPQ5VYV7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms