Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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