Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNT1Q5JUK3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms