Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL12Q53G59 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms