Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPAT3Q53EU6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms