Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
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SPHKAPQ2M3C7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
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SPHKAPQ2M3C7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPHKAPQ2M3C7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPHKAPQ2M3C7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
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