Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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