Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN3Q16667 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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