Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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