Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FXNQ16595 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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FXNQ16595 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FXNQ16595 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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