Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms