Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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VPS72Q15906 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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