Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms