Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNHIT3Q15649 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms