Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKIV2LQ15477 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms