Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIX1Q15475 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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