Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NCAPHQ15003 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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