Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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