Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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DDX39BQ13838 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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DDX39BQ13838 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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DDX39BQ13838 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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DDX39BQ13838 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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